中国大陆科学钻探工程的组织管理机构位于北京中国大陆科学钻探工程中心（工程部），项目的实施地点位于江苏省东海县（现场指挥部），而该工程项目的科学研究基地位于北京的中国地质科学院内（地学部）。与该项工程相配套的网络系统亦由位于北京的工程部、地学部和位于江苏东海现场指挥部的两地三点3个局域网络构成 。

    工程实施过程中每天有大量的地质、钻探、地球物理、测井、测试分析等多个领域的工程数据和研究测试数据，这些数据根据需要分别存储在现场指挥部、北京地学部和ICDP的数据库中，部分科研数据和工程进展等信息需要及时发布在中国大陆科学钻探中心的互联网站以及国际大陆科学钻探（ICDP）的网站上，以便位于世界各地的科研和工程技术人员及时了解最新的工程进展情况。

    信息中心的主要任务保证两地三点的计算机网络系统的正常运行,开发维护工程的信息管理系统,负责互联网站的建设与信息发布工作.大家现在看到的CCSD网站即是由信息中心负责开发建设的.